Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLD1Q13393 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLD1Q13393 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.6 ms