Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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CLN3Q13286 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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CLN3Q13286 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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CLN3Q13286 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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