Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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