Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2AQ12879 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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