Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARDQ03181 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms