Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms