Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms