Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms