Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms