Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms