Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A2P55011 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms