Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms