Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRXP46100 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRXP46100 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRXP46100 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRXP46100 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRXP46100 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRXP46100 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRXP46100 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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