Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA4P43681 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms