Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms