Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

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Length 52 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PLNP26678 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PLNP26678 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PLNP26678 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PLNP26678 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PLNP26678 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PLNP26678 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PLNP26678 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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PLNP26678 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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PLNP26678 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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PLNP26678 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PLNP26678 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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PLNP26678 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PLNP26678 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PLNP26678 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PLNP26678 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PLNP26678 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PLNP26678 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PLNP26678 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PLNP26678 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PLNP26678 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PLNP26678 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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