Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC5A1P13866 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms