Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TYMSP04818 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms