Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms