Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms