Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 447.5 ms