Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIT1Q9Y2X7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GIT1Q9Y2X7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GIT1Q9Y2X7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms