Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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