Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms