Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CARD11Q9BXL7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CARD11Q9BXL7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CARD11Q9BXL7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms