Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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