Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms