Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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