Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms