Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms