Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF128Q8TEB7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF128Q8TEB7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms