Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms