Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms