Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TTC29Q8NA56 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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