Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms