Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms