Protein–RNA interactions for Protein: Q8N319

C6orf223, Uncharacterized protein C6orf223, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf223Q8N319 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms