Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms