Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPCAT2Q7L5N7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms