Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms