Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms