Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms