Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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