Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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