Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms