Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIDRQ14159 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms