Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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HTR4Q13639 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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HTR4Q13639 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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HTR4Q13639 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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HTR4Q13639 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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