Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DNASE1L3Q13609 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DNASE1L3Q13609 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms