Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms