Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms